Output Services is hiring: Machine Learning Engineer (NYC) in New York

The Role

Join our team and help build the world's first biological reasoning model. Work with us to build generative foundational models that decode biological systems across scales - from molecules to organisms - enabling us to predict, understand, and program living systems in ways never before possible.

Output is currently in stealth, operated by a team of repeat founders and biotech veterans with multiple exits in AI x Bio, and backed by top-tier VCs including Y Combinator.

As a Machine Learning Engineer, you'll work alongside our founders and team members to develop and implement cutting-edge AI systems capable of complex biological reasoning across multiple scales.

• You will build foundational models for biology capable of reading and writing biology at scale
• You will develop deep generative models for biological applications, exploring innovative architectures to capture the complexities of multi-scale biological systems
• You will work on distributed training systems to scale our models to billions of parameters, optimizing for performance and efficiency across multi-GPU and multi-node setups while handling large-scale biological datasets
• You will engineer efficient data pipelines to manage and process massive biological datasets, addressing challenges in data loading, splitting, and memory optimization
• You will develop and implement robust evaluation frameworks for complex biological models, ensuring data integrity and preventing leakage across dataset splits

Who We're Looking For:

• You have a Bachelor's in Computer Science, Machine Learning, or a related technical field
• You have 3+ years of experience in developing and implementing deep generative learning models
• You have experience pre-training models and are proficient in distributed computing environments
• You are proficient in Python and have expertise in at least one major deep learning framework (PyTorch, TensorFlow, or JAX)
• You have experience with deep learning and generative architectures such as transformers, diffusion models and autoencoders
• You are skilled in working with terra-scale datasets and scaling models to billions of parameters
• You have a strong understanding of machine learning fundamentals, including various model architectures, optimization techniques, and evaluation metrics
• You have experience in designing and implementing efficient data pipelines for processing and managing large datasets
• You are experienced in developing robust evaluation frameworks and ensuring data integrity in machine learning projects
• You are experienced in code organization, version control, and collaborative software development practices.

Who You Are:

• You have excellent problem-solving skills and the ability to quickly adapt to new challenges
• You exhibit a proactive approach to problem-solving, thinking beyond the specific task, taking ownership of challenges, and pride in solving them
• You have a mature mindset in ambiguous situations, helping to frame questions and seek clarity while making decisions in the face of uncertainty
• You have excellent communication skills and can clearly articulate complex technical concepts
• You are motivated by making a real impact and are committed to tackling problems of significant consequence with determination and creativity

Bonus points

• You have experience applying machine learning to biology or chemistry
• You have contributed to open-source machine learning projects or published research papers in the field of AI/ML
• You have experience optimizing machine learning models for high-performance computing environments
• You are familiar with ML-Ops practices and tools for managing ML experiments and deployments

Our Values

♥ Heart: We foster a culture of ownership. We are assembling a team of individuals who are passionate and take pride in their contributions.

Excellence: We have an unwavering commitment to excellence and continuously challenge ourselves to reach the highest standards.

Practicality: We value practicality and results-oriented thinking. We are committed to making a tangible impact on the lives of patients and the broader community.

Honesty: We place a high value on honesty and directness. We firmly believe in addressing issues as they arise, in an open and transparent manner.

Fun: We believe that life is too short to not have fun. Our goal is to create a workplace that is fun, engaging, rewarding and fulfilling.

What We Offer

• We encourage new and different ideas, creativity and contrarian thinking
• Healthy feedback focused environment to help you strive - leadership will have high expectations, regularly share constructive feedback, support you and help you grow, and welcome receiving feedback and ideas from you
• You own your day-to-day management. What we care about is that we all hit our milestones
• Competitive salary and equity in a growing, well-funded startup
• Excellent medical, dental, and vision coverage

In Summary: Output is currently in stealth, operated by a team of repeat founders and biotech veterans with multiple exits in AI x Bio, backed by top-tier VCs including Y Combinator . As a Machine Learning Engineer, you'll work alongside our founders and team members to develop and implement cutting-edge AI systems capable of complex biological reasoning across multiple scales .

En Español: El papel

Únete a nuestro equipo y ayude a construir el primer modelo de razonamiento biológico del mundo. Trabaje con nosotros para construir modelos fundamentales generativos que descifran los sistemas biológicos en todas las escalas - desde moléculas hasta organismos - permitiéndonos predecir, comprender y programar sistemas vivos de una manera nunca antes posible.

La producción está actualmente en sigilo, operada por un equipo de fundadores repetidos y veteranos de biotecnología con múltiples salidas en AI x Bio, y respaldada por VCs de primer nivel incluyendo Y Combinator.

Como Ingeniero de Aprendizaje Automático, trabajará junto a nuestros fundadores y miembros del equipo para desarrollar e implementar sistemas AI de vanguardia capaces de razonamiento biológico complejo en múltiples escalas.

• Construirás modelos fundamentales para la biología capaces de leer y escribir biología a escala
• Desarrollará modelos generativos profundos para aplicaciones biológicas, explorando arquitecturas innovadoras para capturar la complejidad de los sistemas biológicos a escala múltiple
• Trabajarás en sistemas de capacitación distribuidos para escalar nuestros modelos a miles de millones de parámetros, optimizando el rendimiento y la eficiencia en configuraciones multi-GPU y múltiples nodos mientras manejas conjuntos de datos biológicos a gran escala
• Ingenierará flujos de datos eficientes para gestionar y procesar conjuntos masivos de datos biológicos, abordando los desafíos en la carga de datos, división y optimización de memoria
• Desarrollará e implementará marcos de evaluación sólidos para modelos biológicos complejos, garantizando la integridad de los datos y evitando filtraciones entre las divisiones del conjunto de datos

¿A quién buscamos?

• Tiene una licenciatura en ciencias de la computación, aprendizaje automático o un campo técnico relacionado
• Tiene más de 3 años de experiencia en el desarrollo e implementación de modelos de aprendizaje generativo profundo
• Tiene experiencia en modelos de pre-entrenamiento y es experto en entornos informáticos distribuidos
• Usted es competente en Python y tiene experiencia en al menos un marco de aprendizaje profundo importante (PyTorch, TensorFlow o JAX)
• Tiene experiencia en aprendizaje profundo y arquitecturas generativas como transformadores, modelos de difusión y autoencoders
• Usted es hábil en trabajar con conjuntos de datos a escala terra y escalar modelos para miles de millones de parámetros
• Usted tiene una sólida comprensión de los fundamentos del aprendizaje automático, incluyendo varias arquitecturas de modelos, técnicas de optimización y métricas de evaluación
• Tiene experiencia en el diseño e implementación de tuberías eficientes para procesar y gestionar grandes conjuntos de datos
• Tiene experiencia en el desarrollo de marcos de evaluación sólidos y garantizar la integridad de los datos en proyectos de aprendizaje automático
• Tiene experiencia en la organización del código, el control de versiones y las prácticas colaborativas para desarrollar software.

Quién eres:

• Tiene excelentes habilidades para resolver problemas y la capacidad de adaptarse rápidamente a los nuevos desafíos
• Mostras un enfoque proactivo para resolver problemas, pensando más allá de la tarea específica, tomando posesión de los desafíos y orgulloso en solucionarlos
• Tienes una mentalidad madura en situaciones ambiguas, ayudando a formular preguntas y buscar claridad mientras tomas decisiones frente a la incertidumbre
• Tiene excelentes habilidades de comunicación y puede articular claramente conceptos técnicos complejos
• Usted está motivado por hacer un impacto real y se compromete a abordar problemas de consecuencias significativas con determinación y creatividad

Puntos de bonificación

• Tiene experiencia aplicando el aprendizaje automático a la biología o química
• Ha contribuido a proyectos de aprendizaje automático de código abierto o ha publicado trabajos de investigación en el campo de la IA/ML
• Tiene experiencia optimizando modelos de aprendizaje automático para entornos informáticos de alto rendimiento
• Usted está familiarizado con las prácticas y herramientas de ML-Ops para gestionar los experimentos y implementaciones de ML

Nuestros valores

¿Por qué no? El corazón: Fomentamos una cultura de propiedad. Estamos reuniendo un equipo de individuos apasionados y orgullosos de sus contribuciones.

Excelencia: Tenemos un compromiso inquebrantable con la excelencia y continuamente nos desafiamos a alcanzar los más altos estándares.

Práctica: Valoramos la practicalidad y el pensamiento orientado a los resultados.

La honestidad: Damos un alto valor a la honestidad y la franqueza, creemos firmemente en abordar los problemas que surjan de una manera abierta y transparente.

Divertido: Creemos que la vida es demasiado corta para no divertirnos.

Lo que ofrecemos

• Alentamos nuevas y diferentes ideas, creatividad y pensamiento contrario
• Un entorno enfocado en la retroalimentación saludable para ayudarlo a esforzarse - el liderazgo tendrá altas expectativas, compartirá con regularidad comentarios constructivos, lo apoyará y le ayudará a crecer, y dará la bienvenida a recibir comentarios e ideas de usted
• Lo que nos importa es que todos alcancemos nuestros hitos.
• Salario y capital competitivos en una empresa emergente, bien financiada
• Excelente cobertura médica, odontológica y visual